Eelmise peatüki riigi ja KOV üksuste haldusorganite loetelus kohtasid juba haldusorganite erinevaid liike: valitsusasutus, riigi ametiasutus, KOV üksuse ametiasutus, põhiseadusorgan, KOV ametiasutuse hallatav asutus jne. Haldusorganeid liigitatakse lähtudes erinevatest liigitusalustest. Olenevalt sellest, milline on nende õiguslik staatus, kas nad on avaliku võimu pädevusega või mitte, millise haldusekandja organiks nad on, milline on nende asend haldusorganite süsteemis, millist funktsiooni nad täidavad või milline on nende tegutsemise vorm. 

Nii võime rääkida organi haldusekandja järgi: 

• riigi haldusorganitest (näiteks Sotsiaalministeerium)
• KOV haldusorganitest (näiteks Pärnu Linnavalitsus)
• jm-dest - teiste haldusekandjate organitest
  • teiste avalik-õiguslike juriidiliste isikute organid (näiteks Eesti Panga Nõukogu)
  • eraõiguslike haldusekandjate organid (näiteks AS Karell juhatus - AS-ga Karell on riigi Terviseamet sõlminud halduslepingu kiirabiteenuse osutamiseks: vt http://www.terviseamet.ee/fileadmin/dok/Tervishoid/brigaadid/AS_Karell_Kiirabi.pdf) .

Haldusorganeid saab liigitada nende funktsiooni järgi näiteks:

• haldusjärelevalveorganiteks (õiguskantsler, maavanem, Riigikontroll)
  • Riigikontrolli nimetatakse ka majanduskontrolli organiks

• riikliku järelevalve organiteks ehk korrakaitseorganiteks (PPA, MuPo)
  • majandushaldusasutused kui korrakaitseorgani eriliik vastavalt majandustegevuse üldosa seadustikule
    

• sotsiaalhoolekandeorganiteks jne.  

Käesolevas õpiobjektis pöörame enam tähelepanu kolmele liigitusalusele:

1) haldusorganite liigid nende vormi järgi:

• asutusena tegutsevad haldusorganid -asutused
• koguna tegutsevad haldusorganid - kollektiivorganid
• isikuna tegutsevad haldusorganid - personaalorganid

2) riigi ja KOV haldusorganite liigid selle järgi, kas nende pädevuse põhisisuks on avaliku võimu teostamine või mitte:

• avaliku võimu pädevusega ametiasutused ATS-i järgi, sealh valitsusasutused VVS järgi
• ametiasutuste hallatavad asutused - valitsusasutuste hallatavad riigiasutused VVS järgi ja KOV üksuste ametiasutuste hallatavad asutused KOKS-i järgi

 3) Haldusorganid jagunevad nende omavahelise asetuse järgi haldusorganite süsteemis (vt vasakul menüüs Halduse organisatsioonilised süsteemid):

• subordinatsioonilises (alluvus)suhtes olevateks haldusorganiteks
  • kõrgemalseisev haldusorgan
  • madalamalseisev haldusorgan
• koordinatsioonilises suhtes olevateks haldusorganiteks

 Lisaks mitmetele ülaltoodud liigitustele ja siin ka mittetoodud liigitusalustele jagunevad haldusorganid põhiseadusliku staatuse järgi:

• põhiseadusorganid (organ, mis on nimetatud põhiseaduses ja millele on antud põhiseadusega pädevus ning mis tegutseb täidesaatva võimu sfääris): Vabariigi Valitsus, Vabariigi President, õiguskantsler ja Riigikontroll
• jm haldusorganid