Järelevalvet PPA valdkondlike osakondade ja prefektuuride tegevusakavade ja eelarvete üle teostab PPA peadirektor.

Samaaegselt SiM-ile esitatava 5, 9, ja 12 kuu aruandlusega toimub analoogiline aruandlus PPA valdkondade ja prefektuuride osas PPA siseselt. Aruandekohustuslikud on põhiosakondade juhid, prefektid, administratsiooni (tugivaldkondade) juht, koordinatsioonibüroo, sisekontrollibüroo ja siseauditibüroo juhid.

Ülevaade peab sisaldama (Einberg, U. 2010):

• tegevuskava indikaatorite ja meetmete 5 kuu saavutustasemeid, võrdlust eelmise aasta saavutustasemega ja võrdlust kolme eelneva aasta keskmise saavutustasemetega;
• olulisemate tegevuste ja oodatavate tulemuste hetkeseis meetmete kaupa;
• kuluplaani täitmise ülevaade;
• vajadusel tegevuskava muutmise ettepanekud.

Majandusaasta aruande tegevuskava täitmist puudutava osa koostab valdkondlike osakondade 12 kuu tegevuskava täitmise aruande alusel PPA koordinatsioobibüroo planeerimistalitus. Majandusaasta aruande rahalist täitmist puudutava osa koostab PPA finantsbüroo.