VangS § 64 lg 3 kohaselt protokollitakse kogu distsiplinaarmenetluse käik ning protokollile kirjutab alla distsiplinaarmenetluse läbiviinud vanglaametnik (VangS § 64 lg 3). Sellest võiks järeldada, et distsiplinaarmenetluse protokoll on dokument, mis kajastab kõiki distsiplinaarmenetluse käigus tehtud toiminguid ja kogutud dokumente. VangS § 64 lg 3 annab volitus-normi, mille kohaselt protokolli vorm ja sellesse kantavad andmed määratakse kindlaks VSKE. VSKE § 97 nähakse ette, et distsiplinaarmenetluse protokoll koostatakse ainult juhtudel, kui kinnipeetavat süüdistatakse distsipliinirikkumises (VSKE § 97 lg 1). Sellises for-muleeringus sarnaneb distsiplinaarmenetluse protokoll pigem kohtueelse menetluse kokku-võttele ja süüdistusaktile (KrMS § 153 ja § 154) kriminaalmenetluses või väärteoprotokollile (VTMS § 68 ja § 69). VSKE ei reguleerita, kuidas dokumenteeritakse distsiplinaarmenetlus siis, kui kinnipeetavat ei süüdistata distsiplinaarsüüteo toimepanemises - selles osas on määrus lünklik ega hõlma kogu volitusnormiga kindlaksmääratud volitust.

Kinnipeetava kohta algatatud distsiplinaarmenetluse protokoll koosneb põhitekstist ja sellele manustatud dokumentidest (protokolli lisad). Protokoll peab terviklikult andma ülevaate distsiplinaarmenetluse käigus tuvastatud asjaoludest ning neid tõendavatest tõenditest ning sisaldama ettepanekut distsiplinaarkaristuse määramise kohta.

Protokolli märgitakse järgmised andmed:

1. distsipliinirikkuja ees- ja perekonnanimi ja isikukood või selle puudumise korral sünnikuupäev;
2. distsipliinirikkumise aeg ja koht;
3. distsipliinirikkumise asjaolude detailne kirjeldus;
4. viide õigusakti sättele, mida on rikutud;
5. viide kinnipeetavalt võetud seletusele, sealhulgas sellele, kas isik tunnistab oma süüd või mitte;
6. viide tunnistajatelt võetud seletustele, sealhulgas asjaolude kirjeldus, mis tõendavad distsiplinaarsüütegu;
7. viide muudele tõenditele ja nende asukohale;
8. loetelu asjaoludest, millest peab selguma, milliste faktide ning tõendite alusel luges menetluse läbiviija süü tõendatuks;
9. põhjendatud ettepanek distsiplinaarkaristuse kohta;
10. protokolli koostamise aeg;
11. protokollile lisatud materjalide loetelu;
12. protokolli koostanud vanglaametniku nimi ja ametinimetus;
13. kinnipeetava allkiri protokolliga tutvumise kohta;
14. distsiplinaarmenetluse protokolli tutvustanud vanglaametniku nimi ja ametinimetus.

(VSKE § 97 lg 2) Protokollile kirjutab alla selle koostanud vanglaametnik. (VSKE § 97 lg 3) Protokollile lisatakse: 1) tunnistajate seletused; 2) distsipliinirikkumise avastanud ametniku ettekanne; 3) kinnipeetava seletus ja kirjalikud märkused protokolli kohta; 4) õiend kinnipeetava kehtivate distsiplinaarkaristuste kohta; 5) õiend kartserisse paigutamise kohta (VSKE § 98).