VAAK koostamine toimub ministeeriumi osakondade ja valitsemisala asutuste koostöös. PPA partneriteks on SiM korrakaitse ja kriminaalpoliitika osakond (edaspidi KKPO) ja migratsiooni- ja piirivalvepoliitika osakond (edaspidi MPPO). VAAK sisejulgeoleku tegevusvaldkonna osa koostamise ja elluviimise korraldamise eest tervikuna vastutab sisejulgeoleku asekantsler.

SiM-i vastav osakond koostab oma vastutusvaldkonna kohta ametilt saadava teabe alusel tegevusvaldkonna kirjelduse ja hetkeolukorra analüüsi ning eelmise aasta peamiste saavutuste ja probleemide ülevaate ning edastab selle sisejulgeoleku asekantsleri määratud üksusele või ametnikule, kes koondab ja sõnastab esitatud materjalid tegevusvaldkonna ühtseks kirjelduseks. Teiste asutuste ja osakondadega puutes olevaid või ühiseid meetmeid ja tegevusi ette valmistades peab SiM vastutava osakonna juhataja sõnastuse ja sisu kokku leppima teis(t)e vastutava(te) üksus(t)ega ning vajadusel sisejulgeoleku asekantsleriga

VAAK-i eesmärgid avaldatakse novembri teisel esmaspäeval. VAAK koostamise lähteülesandes esitab Siseministeerium valitsemisala asutustele (sh PPA) VAAK materjalide esitamiseks konkreetsed tähtajad, mis ei pruugi kattuda käskkirjas määratud tähtaegadega, seetõttu võivad muutuda ka käesolevas alapeatükis toodud tähtajad.

Juhul, kui soovitakse muuta valitsemisala arengukava eesmärkide indikaatoreid või meetmete sõnastust järgnevaks neljaks aastaks, millega kaasneb ka meetme sisu muutus, peavad need olema asekantslerite poolt asjaosaliste ministritega läbi räägitud ning kinnitatuna valitsemisala asutustele tegevuste planeerimiseks edastatud hiljemalt novembri teisel esmaspäeval. Juhul, kui nimetatuisse selleks ajaks muutusi ei ole sisse viidud, lähtuvad kõik osapooled varasemail aastail seatud eesmärkidest ja meetmetest. Asutused vaatavad varasemad materjalid üle koostöös SiM vastutava osakonnaga ning esitavad kirjalikud ettepanekud nende tegevust käsitleva arengukava osiste muutmiseks vastutavale SiM-i osakondadele elektronkujul hiljemalt detsembri viimasel nädalal.

Vastutav ministeeriumi osakond või asekantsleri poolt määratud ametnik esitab omalt poolt korrigeeritud, kõigi asjassepuutuvate osapooltega (sh asutustega) läbiräägitud ning vajadusel täiendatud materjali elektronkujul SiM-i arendusnõunikule hiljemalt jaanuari kolmandal esmaspäeval. Veebruari esimeseks esmaspäevaks peavad asutused olema sisestanud VAAK-i projekti põhjal koostatud finantsplaani riigieelarve infosüsteemi REIS.

Juhendi kohaselt on meetmete rakendamise finantsplaani väljatöötamise nõustamiseks SiM-i rahandusosakonna juhi poolt määratud ametnik. Ministeeriumi arendusnõunik ühtlustab vajadusel erinevate osapoolte koostatud VAAK-i tekstilise osa SiM-i ühtseks dokumendiks ning edastab selle esimeseks märtsiks rahandusministeeriumile.

Kokkuvõtlikult on VAAK-i koostamise protsess ning SiM ja PPA koostöö kujutatud järgneval skeemil. 

Joonis. VAAK-i koostamise protsess ning SiM ja PPA koostöö. Allikas: Arengukava planeerimise protsess. Siseministeeriumi kommentaar on, et arvestades, et arengu- ja tegevuskavade ning riigieelarve infosüsteemi põhjal riigieelarve planeerimise protsess on üle riigi alles kujunemisjärgus, võib eeltoodud protseduurides toimuda vastavalt rahandusministeeriumi suunistele muudatusi, mis aga oma olemuselt ei välju riigieelarve seaduse ja Vabariigi Valitsuse l3.detsembri 2005 määruse nr 302 raamidest.