Metoodilises mõttes ei erine PPA riskijuhtimise käsitlus oluliselt SiM-i metoodilisest lähenemisest. Küll on aga teatavaid erinevusi protsessi läbiviimises. Põhiline erinevus metoodilises mõttes seisneb selles, et nii riskide tuvastamine, kui ka riskide hindamine toimub PPA-s regionaalsel tasemel, valdkondlikul tasemel ning PPA tasemel. Hindamise tulemused on sisendiks nii SiM-i strateegilise kava (VAAK) koostamisele, kui ka valdkondlike ja prefektuuride igaaastaste tegevuskavade koostamisele. Prefektuuri või valdkonna tasandil riskiläve ületavad riskid ei pruugi ületada PPA või ministeeriumi tasandi riskiläve ning võivad seetõttu jääda tähelepanu alt välja. MFKO poolt välja töötatud soovituslik riskide tuvastamise ja hindamise protsessi puhul selline oht puudub. Vastava tasandi riskiläve ületavate riskide puhul planeeritud riskimaandamismeetmed on otseseks sisendiks vastava tasandi aastase tegevuskava koostamisele. Samas on PPA tasandil riskiläve ületavad riskid sisendiks SM riskide hindamise protsessi ja juhul, kui nad ületavad ministeeriumi tasandil riskiläve, siis planeeritakse nende maandamiseks vajalikud meetmed üldjuhul juba strateegilise kavas.

Riskijuhtimise protsesside aja- ja tegevuskava on kokkuvõtlikult järgmine:

September - riskide tuvastamine

1. PPA riskijuht koostab regionaalsete ja valdkondlike riskide loendi koostamise/aktualiseerimise lähteülesande ning edastab selle täitmiseks valdkondlikele/regionaalsetele riskijuhtidele;

2. Valdkondlikud ja regionaalsed riskijuhid koostavad/aktualiseerivad valdkondlike/regionaalsete riskide loendi, ühtlustavad selle ning edastavad PPA riskijuhile;

3. PPA riskijuht ühtlustab PPA riskide loendi;

Oktoobri I pool - riskide hindamine

4. Valdkondlikud ja regionaalsed riskijuhid määratlevad riskide hindajate pädevuse (milliseid valdkondlikke/regionaalseid riskide loendis olevaid riske on hindaja pädev hindama);

5. Riskide hindajad hindavad nende pädevusse kuuluvad riskide loendis olevad riskid;

6. PPA riskijuht tagab riskide hindamise tulemuste andmekvaliteedi ning statistilise töötlemise ning edastab hinnatud riskid aktsepteeritava riskitaseme määramiseks PPA juhtgrupile

7. PPA juhtgrupp määratleb valdkondlike ja regionaalsete riskide aktsepteeritava riskitaseme;

Oktoobri II pool - riskide maandamismeetmete planeerimine

8. PPA riskijuht edastab aktsepteeritavat riskitaset ületavate riskide loendi valdkondlikele ja regionaalsetele riskijuhtidele riskide maandamismeetmete planeerimiseks;

9. Valdkondlikud ja regionaalsed riskijuhid koostavad valdkondlike ja regionaalse iseloomuga riskide maandamisviiside kataloogi ning edastavad selle PPA riskijuhile;

10. PPA riskijuht koostab PPA riskide maandamisviiside kataloogi;

November - jääkriskide hindamine

11. Juhtgrupp koos PPA riskijuhiga hindavad jääkriske (riski taseme hindamine pärast planeeritud maandamismeetmete rakendamist);

12. Juhtgrupp koos PPA riskijuhiga valivad adekvaatsed riskimaandamisviisid ja korrigeerivad vajadusel aktsepteeritavat riskitaset;

13. PPA riskijuht edastab riskihindamise tulemused Siseministeeriumile.

Riskide juhtimise protsessiga on seotud: